Các biện pháp bao gồm siết chặt khung pháp lý, mở rộng thanh tra và phối hợp liên ngành giữa cơ quan thuế, hải quan và đầu tư.

Theo số liệu của Bộ Tài chính, năm 2023 có tới 56% doanh nghiệp FDI báo lỗ dù doanh thu và tài sản tăng, trong đó hơn 5.000 doanh nghiệp âm vốn chủ sở hữu với tổng lỗ lũy kế khoảng 908.000 tỉ đồng. Cơ quan thuế cho rằng đây là dấu hiệu cho thấy nguy cơ chuyển giá, đặc biệt trong các tập đoàn đa quốc gia với cấu trúc giao dịch phức tạp.

Trong năm 2023, cơ quan thuế đã thanh tra 1.258 doanh nghiệp FDI, truy thu và xử phạt tổng cộng hơn 3.300 tỉ đồng, đồng thời giảm lỗ hơn 20.000 tỉ đồng. Năm 2024, số doanh nghiệp được thanh tra giảm còn 920, với số tiền truy thu và phạt đạt 1.807 tỉ đồng. Riêng tám tháng đầu năm 2025, số thuế tăng thu qua thanh kiểm tra đạt hơn 10.400 tỉ đồng.

Để siết quản lý, Bộ Tài chính đã trình Chính phủ ban hành Nghị định 20/2025/NĐ-CP, sửa đổi quy định về giao dịch liên kết nhằm tăng minh bạch, giảm chồng chéo và bảo vệ nhà đầu tư tuân thủ đúng luật. Đồng thời, các địa phương được yêu cầu xây dựng chuyên đề thanh tra rủi ro cao và tăng hợp tác quốc tế về chia sẻ dữ liệu thuế.

Các chuyên gia cho rằng việc ứng dụng công nghệ số, phân tích dữ liệu lớn (Big Data) và trí tuệ nhân tạo (AI) sẽ giúp cơ quan thuế sớm phát hiện hành vi chuyển giá, bảo đảm môi trường cạnh tranh công bằng và nguồn thu bền vững cho ngân sách.