Theo Bộ Tài chính, mức thuế VAT 5% áp dụng cho nông sản qua khâu thương mại đang gây nhiều bất cập. Doanh nghiệp xuất khẩu cá tra, hồ tiêu, cà phê phải nộp thuế đầu vào rồi làm thủ tục hoàn thuế, dẫn đến đọng vốn và chi phí cao, trong khi nông sản nhập khẩu lại không chịu VAT, tạo nên sự bất bình đẳng.

Điều này khiến hàng trong nước kém cạnh tranh hơn do doanh nghiệp phải vay vốn ngân hàng để nộp thuế, còn hàng nhập khẩu thì không.

Với ngành sản xuất thức ăn chăn nuôi, thuế đầu vào 5% không được khấu trừ, buộc doanh nghiệp tính vào giá thành, khiến giá bán tăng và giảm sức cạnh tranh với sản phẩm nhập khẩu vốn được miễn thuế.

Ngoài ra, quy định doanh nghiệp chỉ được hoàn thuế sau khi bên bán đã kê khai nộp thuế cũng khiến việc hoàn thuế chậm trễ, gây rủi ro và thiếu minh bạch cho doanh nghiệp mua hàng.

Bộ Tài chính cho biết việc sửa đổi luật nhằm hoàn thiện chính sách VAT, tháo gỡ vướng mắc, khơi thông dòng vốn, giảm gánh nặng hành chính và tạo động lực phát triển cho doanh nghiệp.

Dự thảo sẽ bảo đảm tính ổn định, không phát sinh thêm thủ tục hay bộ máy mới, đồng thời phù hợp với yêu cầu phát triển kinh tế – xã hội giai đoạn tới.